2024-01-24
今天我们探讨的是 一种哌嗪-1,4-二乙磺酸(PIPES,又名哌嗪-N,N'-双(2-乙磺酸),哌嗪-1,4-二(2-乙磺酸))在基因组测序技术中的应用。
(哌嗪-1,4-二乙磺酸结构式)
哌嗪-1,4-二乙磺酸CAS是5625-37-6,分子式为 C8H18N2O6S2,主要用作生物缓冲剂,可用于实验室研发过程和化工生产过程中。
随着基因组测序技术的发展,植物基因组的序列、结构和功能研究飞速发展,而获得高纯度、高含量和高完整度的植物基因组DNA是基因组测序技术得以应用的首要前提。为了更好的研究和理解基因和RNA的生物学功能,人们发展出一些提取植物组织的RNA方法。传统的植物RNA提取方法主要有Trizol法,SDS法,CTAB法,异硫氰酸胍法等。
上述方法主要在加入水性缓冲剂和有机萃取剂之后进行萃取,核酸保留在水相中,很多杂质被留在有机相而除去。但是,在水相中还会保留一些少许的核酸污染物,需要在更进一步纯化步骤中去除。因此,新的替代方法出现,这些方法主要是基于把核酸选择性吸附到固体微柱上,然后,通过清洗把污染物去除,最后,将纯化的核酸从微柱上洗脱下来。但是,这些核酸提取方法随着步骤的增加,所用的试剂种类和提取核酸的时间也增加了。
因此,CN113717969A专利提供了一种能够快速而又廉价提取植物组织核酸的试剂和方法。该方法需要提供一类裂解、结合和洗涤试剂,该洗涤试剂包含至少一种能溶解植物核酸的盐类化合物,至少一种防止DNA降解的金属离子螯合剂,至少一种缓冲化合物,能溶于水的有机物,苯酚或水饱和苯酚,至少一种RNase A酶抑制剂混合物。
上述缓冲液可以为三(羟甲基)氨基甲烷(TRIS)、N-(三(羟甲基)甲基)甘氨酸(TRICINE)、N,N-双(2-羟乙基)甘氨酸(BICINE)、3-(N-吗啉代)丙磺酸(MOPS)、N-(2-羟乙基)哌嗪-N-(2-乙磺酸)(HEPES)、哌嗪-1,4-二乙磺酸(PIPES)、N-环己基-2-氨基乙磺酸(CHES)、2-(N-吗啉代)乙磺酸(MES)等。
本专利提出的植物组织核酸提取试剂不使用有毒试剂,对植物核酸提取过程是绿色环保的,有利于实验者的健康和减少对环境的破坏,试剂组成简单而且非常稳定。
参考文献
CN113717969A 一类植物组织核酸提取试剂和方法.